А всё таки неудачный глагол вы используете. Есть целый класс программ, которые именно ухудшают фонограммы - добавляют шипы, скрипы, щелчки, фазовые искажения и прочие прелести. Конвертация - это нечто другое.

Свои диски священны! Правда, SACD-диски всё равно сохраняются как флаки! Поскольку обычно в SACD диски, записанные в 21-м веке, т.е.очень плохие исполнительски (известное же дело, что хороший музыкант вымер). Кроме того, SACD специально пишут наиболее молодые и никому не известные люди, т.к. их конечный потребитель любит звук, т.е. хорошую спектрограмму, а на исполнение ему плевать. Так обстоит дело с точки зрения оправдания самого процесса ухудшения звука. Истинные же причины находятся в области психиатрии. Никто ж не может понять, зачем вам нужно непременно 722 варианта 9-й симфонии Бетховена, 450 Гольдберг-вариаций или 127 Трубадуров. Все считают, что вы сошли с ума, да и сами вы в глубине души ненавидите себя и всякого, кто оскверняет хорошо известную музыку своими неумелыми и наспех записанными "интерпретациями". Не в силах бороться со своей привычкой складывать эти бесконечные тра-ля-ля в красивые кучи, не в силах заставить себя просто выбросить это подальше, вы с особенной злобностью хотя бы доводите битрейт до стандартного... Если и сохранять повышенный битрейт, то для благородных стареньких исполнений. Которые тоже ещё далеко не все собраны, и каждый день приносит 5-10 филигранно сделанных алмазов из старых пластиночных рипов, новых официальных оцифровок исторических инкунабул и безвестных радиозаписей

с более низким качеством флака (например не 8 или 9, а ниже)

Уровень 8 это максимальное значение, но не качества, а степени сжатия, каковая на качество отнюдь не влияет. При любом значении это будет lossless.

Да, будет тоже lossless, но будет с меньшим средним битрейтом...
Влияние сжатия на качество это вопрос спорный